Resumen

INTRODUCCIÓN: La elevada incidencia de infecciones causadas por Chlamydia trachomatis junto al aumento progresivo de casos de linfogranuloma venéreo (LGV), favorecen el intercambio genético entre genotipos invasivos y no invasivos de C. trachomatis. En el año 2013 nuestro grupo publicó la detección de una nueva variante resultante de la recombinación en el gen pmpH entre genotipos invasivos (asociados a LGV) y no invasivos (genotipo G). OBJETIVOS: Determinar la evolución temporal y la dispersión de la variante recombinante descrita en la población que acude al Centro Sanitario Sandoval para estudio de ITS. MATERIAL Y MÉTODOS: Se seleccionaron 409 muestras positivas por métodos comerciales para C. trachomatis y negativas para genotipos asociados a LGV correspondientes al periodo 2009-2015 (86 en 2009-2010, 131 en 2013-2014 y 192 en 2015). En cuanto al origen, 187/409 (45,7%) eran rectales, 102/409 (24,9%) uretrales, 79/409 (19,3%) cervicales y 41/409 (10%) faríngeas. La detección de la variante recombinante en el gen pmpH se realizó mediante una PCR diseñada específicamente para su detección. Para el posterior análisis filogenético se secuenciaron los genes ompA, rs2, lysS, pmpH e incE-F. RESULTADOS: Globalmente, el recombinante se encontró en 112/409 (27,4%) de las muestras clínicas (25,9% durante el periodo 2009-2010, 16% en 2013, 13,5% en 2014 y 36,8% en 2015). En cuanto al origen de las muestras, 59/112 (52,7%) fueron detectadas en muestras rectales, seguido por 25/112 (22,3%) en uretrales, 19/112 (17%) en faríngeas y 9/112 (8%) en muestras cervicales. Durante el periodo 2009-2010, el genotipo recombinante se encontró únicamente en muestras rectales (25,9%), cuya prevalencia se vio incrementada en los años sucesivos, alcanzando el 29,7%, 37,5% y 39,2% en los años 2013, 2014 y 2015, respectivamente. La primera detección de la variante recombinante en localización no rectal ocurrió en dos muestras faríngeas y en una uretral en el año 2014. Sorprendentemente, en el año 2015, la detección del recombinante en estas localizaciones alcanzó el 58,1% y el 34,8%, respectivamente. Finalmente, en el año 2015, también se detectó en muestras de cérvix (21,4% de las muestras). El análisis filogenético del concatenado de genes descritos anteriormente permitió identificar dos ramas evolutivas. Una rama incluye las cepas anteriores al año 2013, caracterizadas por ser detectadas en muestras rectales de hombres que tienen sexo con hombres (HSH), mientras que la otra rama incluye cepas obtenidas en los años sucesivos a 2013, de procedencia rectal y no rectal. La principal diferencia entre ambas ramas es el reemplazamiento del gen ompA del genotipo G en las cepas rectales de HSH, por ompA del genotipo J, lo que habría facilitado su explosiva dispersión en localización rectal y no rectal, tanto en población HSH como población heterosexual. CONCLUSIONES: Se describe por primera vez la fácil y rápida evolución, en tiempo real, de C. trachomatis para mantenerse y dispersarse entre poblaciones diana y hacia poblaciones puente. Esta dispersión está caracterizada por el reemplazamiento del gen ompA-G, con tropismo rectal, por ompA-J con tropismo mixto, lo que facilita su transmisión